Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFNP31947 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFNP31947 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFNP31947 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFNP31947 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFNP31947 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFNP31947 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFNP31947 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFNP31947 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms