Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms