Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms