Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARID4AP29374 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms