Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms