Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms