Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRAFP15056 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRAFP15056 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRAFP15056 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRAFP15056 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms