Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms