Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMBSP08397 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms