Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms