Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms