Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms