Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YBX2Q9Y2T7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms