Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EMILIN3Q9NT22 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms