Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms