Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ACTRT3Q9BYD9 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTRT3Q9BYD9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTRT3Q9BYD9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTRT3Q9BYD9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms