Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARD11Q9BXL7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms