Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms