Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms