Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms