Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2Q8WZ74 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms