Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF12Q8WXF0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF12Q8WXF0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms