Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHDC9Q8NEP7 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms