Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms