Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPFIBP1Q86W92 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms