Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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