Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms