Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1SQ13698 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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