Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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