Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FOXO1Q12778 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FOXO1Q12778 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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