Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms