Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms