Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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