Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms