Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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