Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHP20396 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHP20396 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHP20396 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHP20396 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHP20396 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRHP20396 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRHP20396 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRHP20396 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRHP20396 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRHP20396 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRHP20396 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRHP20396 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms