Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NFKB1P19838 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NFKB1P19838 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NFKB1P19838 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NFKB1P19838 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NFKB1P19838 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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NFKB1P19838 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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NFKB1P19838 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NFKB1P19838 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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