Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CKMT2P17540 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms