Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MYL4P12829 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms