Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DMDP11532 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DMDP11532 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DMDP11532 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
DMDP11532 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DMDP11532 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DMDP11532 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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