Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms