Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms