Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RAB30-201ENST00000260056 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms