Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms