Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SLC6A20Q9NP91 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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