Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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