Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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