Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms