Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLIP4Q8N3C7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms