Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms